Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms