Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDC1Q9BTX1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms