Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms