Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms