Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms