Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms