Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms