Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCZQ96LD1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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