Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM71F1Q96KD3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms