Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPNE2Q96FN4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms