Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC51Q96ER9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC51Q96ER9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms