Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ULK4Q96C45 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms