Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKD1Q969G9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms