Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms