Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO1Q92973 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms