Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms