Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms