Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms