Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms