Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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NME8Q8N427 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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