Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms