Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms