Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms