Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms