Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCSD1Q6JBY9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCSD1Q6JBY9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms