Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZKSCAN2Q63HK3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZKSCAN2Q63HK3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms