Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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