Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACSM3Q53FZ2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACSM3Q53FZ2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms