Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms