Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms