Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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