Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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