Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms