Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACKR1Q16570 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms