Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF56Q15929 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF56Q15929 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZNF56Q15929 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZNF56Q15929 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZNF56Q15929 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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