Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USF2Q15853 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USF2Q15853 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USF2Q15853 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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