Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIP13Q15645 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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