Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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