Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SYCP1Q15431 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SYCP1Q15431 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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SYCP1Q15431 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SYCP1Q15431 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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