Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPD2Q15021 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
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