Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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CHD4Q14839 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD4Q14839 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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