Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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