Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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RFTN1Q14699 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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RFTN1Q14699 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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RFTN1Q14699 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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RFTN1Q14699 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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RFTN1Q14699 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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RFTN1Q14699 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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