Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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GBX1Q14549 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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