Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms