Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CKAP5Q14008 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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