Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
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