Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms