Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOFQ13790 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOFQ13790 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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