Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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